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단백질 분자의 가장 기본적인 조성물은 아미노산으로 아미노산의 구조를 보면 탄소원자 한 개에 아미노기와 카르복실기가 붙어 있으며, 여기에 수소와 R기가 붙어 있는데 R기는 단순히 수소일수도 있고 또는 복잡한 화학구조일 경우도 있다. 이 R기는 아미노산의 종류에 따라 달라지며 여기에 무엇이 붙는가에 따라 각각의 아미노산의 성질이나 기능이 달라진다.